期刊文献+

GSDS:基因结构显示系统 被引量:199

GSDS:a gene structure display server
下载PDF
导出
摘要 构建了一个用于绘制基因结构示意图的网站系统(http://gsds.cbi.pku.edu.cn/)。用户可提交核酸序列、NCBI核酸序列号或基因外显子位置信息,得到基因结构示意图;并可指定在基因结构图上标注某些特定区域。系统允许用户同时输入多个基因,并指定输出次序和标注区域。结果可用位图和矢量图两种图形格式显示。点击位图格式结果,可以查看相应序列。系统提供中英文两种用户界面。 We developed a web server GSDS (Gene Structure Display Server) for drawing gene structure schematic diagrams. Users can submit three types of data: CDS and genomic sequences, NCBI GenBank accession numbers or GIs, exon positions on a gene. GSDS uses this information to obtain the gene structure and draw diagram for it. Users can also designate some special regions to mark on the gene structure diagram. The output result will be PNG or SVG format picture. The corresponding sequence will be shown in a new window by clicking the picture in PNG format. A Chinese version for the main page is also built. The GSDS is available on http://gsds.cbi.pku.edu.cn/.
出处 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2007年第8期1023-1026,共4页 Hereditas(Beijing)
基金 国家重点基础研究发展规划(973计划)项目(编号:2003CB715900) 教育部博士后基金(编号:20060390012) 国家高技术研究发展计划项目(国家863计划) 国家科技大平台项目资助~~
关键词 基因结构示意图 生物信息网络工具 计算机图形 gene structure display bioinformatics web tool computer graphics
  • 相关文献

参考文献4

  • 1Gao G, Zhong Y, Guo A, Zhu Q, Tang W, Zheng W, Gu X, Wei L, Luo J. DRTF: a database of rice transcription factors. Bioinformatics, 2006, 22 (10): 1286-1287.
  • 2Guo A, He K, Liu D, Bai S, Gu X, Wei L, Luo J. DATF: a database of Arabidopsis transcription factors. Bioinformatics, 2005, 21 (10): 2568-2569.
  • 3Kapustin Y, Souvorov A, Tatusova T. Splign-a hybrid approach to spliced alignments. In: Proceedings of RECOMB 2004-Research in Computational Molecular Biology, 2004: 741.
  • 4Olson SA. EMBOSS opens up sequence analysis. European Molecular Biology Open Software Suite. Brief Bioinform, 2002, 3 (1): 87-91.

同被引文献1925

引证文献199

二级引证文献943

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部