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基于谱分析的DNA序列识别算法研究 被引量:1

Research on DNA Sequence Recognition Algorithm Based on Spectral Analysis
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摘要 对基于谱分析的DNA序列识别中相关问题建立了数学模型,并进行了计算及结果分析.提出了一种基于频数二次型的功率谱快速算法和基于帕斯瓦尔定理的信噪比快速算法,建立了基于模糊逻辑的自适应阈值模型,提出了基于重复序列的边界搜索算法,最后利用谱分析对基因突变中的伪鞍部进行了识别. Mathematical models about DNA sequence recognition based on spectral analysis are established, and calculation and results analysis are given out. A fast power spectrum calculation algorithm based on the frequency quadratic form and a fast SNR calculation algo- rithm based on the Pass Val theorem are proposed, and an adaptive threshold model based on fuzzy logic is built, and a boundary search algorithm based on the repeat sequence is proposed, and finally spectral analysis is used to identify the pseudo saddle in the gene mutation,
出处 《数学的实践与认识》 CSCD 北大核心 2013年第14期94-104,共11页 Mathematics in Practice and Theory
关键词 基因编码区 功率谱 信噪比 自适应阈值 gene coding area power spectrum SNR adaptive threshold
  • 相关文献

参考文献4

  • 1王震.基于信号处理方法的基因识别算法研究[D].博士论文,天津大学,2011.
  • 2Sharma S D, Shakya K, Sharma S N. Evaluation of DNA Mapping Schemes for Exon Detection[J]. IEEE ICCCET, 2011: 71-74.
  • 3Ankit Agrawal, Ankush Mittal, Rahul Jain, Raghav Takkar. An adaptive fuzzy thresholding algorithm for exon prediction[J]. IEEE ICCCET, 2008: 211-214.
  • 4美国国家生物信息中心,www.ncbi.corn,2012-9-22.

同被引文献23

引证文献1

二级引证文献1

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