云斑白条天牛COI基因碱基序列长度与基因差异相关性比较

本文以2014年和2019年为害白蜡树和杨树云斑白条天牛雌、雄成虫的COI基因为研究对象,拼接获取8个样品COI基因的初始序列和剪切序列,利用初始序列和剪切序列分别分析比较为害白蜡树和杨树云斑白条天牛雌、雄成虫COI基因在2019年和2014年之间的差异,以此验证序列长度与基因差异的相关性。结果表明:2014年和2019年为害白蜡树和杨树云斑白条天牛雌、雄成虫COI基因序列的碱基含量方面,剪切序列和初始序列获得碱基含量不一致,但差异较小;碱基相似度方面,剪切序列分析所得COI基因的碱基相似度较初始序列变大,但不同样品间的相似度差异规律没有变化。综上所述,云斑白条天牛不同样品COI基因的碱基序列剪切成统一长度后,碱基含量及序列相似度都会发生改变,但变化的幅度较小,对定性分析的结果影响不大,是否需要将碱基序列剪切统一,可根据研究需要自行判断。