摘要
随着分子生物学实验技术的发展和实验方法的改进,如今已经有大量的DNA相关数据。研究者从这些大数据中通过生物信息学的手段寻找关键的信息成为近年来的热门。介绍了计算正选择位点相关软件的发展过程及其现状。
二级参考文献10
-
1Yang Z. Computational molecular evolution[M]. Oxford: Ox-ford University Press, 2006.
-
2Yang Z. PAML: A program package for phylogenetic analy-sis by maximum likelihood[J]. Computer Applications in the Biosciences , CABIOS, 1997, 13(5): 555-556.
-
3Schabauer H, Valle M, Stockinger H, et al. Toward a su-percomputing approach to large scale darwinian evolutionj C] II Phylogenetics , New Data, New Phylogenetic Challenges Follow-up Meeting, 2011: 1.
-
4Schabauer H, Valle M, Pacher C, et al. SlimCodeML: An optimized version of codeML for the branch-site model[C] II Proc of the 26th IEEE International on Parallel and Distribu-ted Processing Symposium Workshops &. PhD Forum (lP-DPSW) , 2012:706-714.
-
5Yang Z, Yoder A D. Estimation of the transition/transver-sion rate bias and species sampling[J].Journal of Molecular Evolution, 1999, 48(3) :274-283.
-
6Val ken borg D, Burzykowski T. A Markov-chain model for the analysis of high-resolution enzymatically 180-labeled mass spectra[J]. Statistical Applications in Genetics and Molecu-lar Biology, 2011, 10(1): 1-37.
-
7Hasegawa M, Kishino H, Saitou N. On the maximum likeli-hood method in molecular phylogenetics] L].Journal of Mo-lecular Evolution, 1991, 32(5) :443-445.
-
8The GNU Profiler [EB/OL]. [2013-05-30]. http://www. cs. utah. edu/ dept/ old/ texinfo/ as/ gprof toe. htrnl.
-
9ZhangJ Z, Nielsen R, Yang Z. Evaluation of an improved branch-site likelihood method for detecting positive selection at the molecular level[J]. Molecular Biology and Evolution, 2005., 22(12) :2472-2479.
-
10van der Pas R. An overview of OpenMP 3. o [EB/OL]. [2009-01-14]. http://openmp. org/mp-documents/ntu-banderpas. pdf.
同被引文献29
-
1谢小芳,黄勤怡,吴为人.植物GH3基因家族的生物信息学分析[J].基因组学与应用生物学,2010,29(5):829-837. 被引量：11
-
2曾文芳,潘磊,牛良,鲁振华,崔国朝,王志强.桃GH3基因家族的生物信息学分析及其在果实发育中的表达[J].园艺学报,2015,42(5):833-842. 被引量：15
-
3曾亚,丁新华,沈祥陵,李香花,王石平.水稻抗病基因介导的抗白叶枯病反应中蛋白质表达谱的比较分析[J].中国水稻科学,2008,22(3):234-242. 被引量：7
-
4聂丽娜,夏兰琴,徐兆师,高东尧,李琳,于卓,陈明,李连城,马有志.植物基因启动子的克隆及其功能研究进展[J].植物遗传资源学报,2008,9(3):385-391. 被引量：85
-
5孙涛,柴团耀,刘戈宇,张玉秀.植物GH3基因家族研究进展[J].生物工程学报,2008,24(11):1860-1866. 被引量：17
-
6胡帅,王芳展,刘振宁,刘亚培,余小林.PYR/PYL/RCAR蛋白介导植物ABA的信号转导[J].遗传,2012,34(5):560-572. 被引量：29
-
7郭贵华,刘海艳,李刚华,刘明,李岩,王绍华,刘正辉,唐设,丁艳锋.ABA缓解水稻孕穗期干旱胁迫生理特性的分析[J].中国农业科学,2014,47(22):4380-4391. 被引量：74
-
8李鸿杰,王盈阁,张夏伟,付凤玲,李晚忱.玉米脱落酸受体基因家族的生物信息学分析[J].核农学报,2015,29(9):1657-1667. 被引量：5
-
9颜志明,王全智,冯英娜,解振强,魏跃.FaPYL9基因调控草莓果实成熟的分子机理[J].西北植物学报,2015,35(12):2379-2384. 被引量：5
-
10徐明飞,吴长兴,苍涛,陈丽萍,陈列忠,蔡磊明,李岗.大豆GH3家族三个成员对20种农药的转录响应[J].植物生理学报,2015,51(12):2188-2194. 被引量：6
引证文献2
-
1郭丽丽,卢世雄,乃国洁,马维峰,毛娟.草莓PYL基因家族的鉴定与非生物胁迫下的表达分析[J].农业生物技术学报,2022,30(12):2315-2332. 被引量：7
-
2郭丽丽,卢世雄,乃国洁,任家玄,苟惠敏,陈佰鸿,毛娟.凤梨草莓和森林草莓GH3基因家族的鉴定与表达分析[J].植物生理学报,2023,59(3):579-598. 被引量：1
二级引证文献8
-
1董媛媛,任家玄,车莉莉,郭丽丽,成永娟,毛娟.苹果CAMTA转录因子家族的鉴定与表达分析[J].植物生理学报,2024,60(1):155-166.
-
2唐伟林,汪霞,康琴,王棵,彭丹丹,孙义凯,吴卫,侯凯,冯冬菊,徐东北.薄荷脱落酸受体基因McPYL4的克隆与表达模式分析[J].中国中药杂志,2024,49(6):1494-1505.
-
3王玉倩,彭丽娟,刘建汀,温庆放,钟凤林,朱海生.普通丝瓜PYL基因家族鉴定及其在果实发育中的表达分析[J].西北植物学报,2024,44(3):408-420. 被引量：1
-
4江转转,陈淑娜,鲍红艳,叶龙雨.悬钩子属植物叶绿体基因组结构特征与系统演化[J].中南林业科技大学学报,2024,44(4):148-158.
-
5梁卫,王海,丰勇青,张澳宁,田雪纯,南昕彤,李文芳,刘飞云,马宗桓.草莓MYB基因家族的鉴定及在果实不同着色期的表达分析[J].农业生物技术学报,2024,32(6):1250-1273.
-
6张晓旭,马媛媛,罗新锐,秦耀新,马天宇,王玉萍.芸豆GH3基因家族鉴定及进化与表达分析[J].西北植物学报,2024,44(9):1433-1444.
-
7兰官却才郎,郭丽丽,马维峰,毛娟,陈佰鸿.葡萄碱基-抗坏血酸转运蛋白(NAT)家族基因的鉴定和表达分析[J].西北农业学报,2024,33(9):1724-1736.
-
8郑重玖,宋孜文,杨俊俊,张兵,艾鹏慧.菊花脑PYL基因家族的全基因组鉴定及表达分析[J].天津农业科学,2024,30(8):9-17.
-
1朴正吉,邱宝鸿,等.长白山自然保护区受胁动物种类及其现状[J].长白山自然保护,1999(3):1-12.
-
2李玟.细胞融合实验方法的改进[J].汕头大学医学院学报,2005,18(3):183-184. 被引量：13
-
3唐伯平,周开亚,宋大祥.分子系统学的发展及其现状[J].生物学通报,1999,34(5):10-12. 被引量：6
-
4勾影波,苏永春.两个无脊椎动物实验方法的改进[J].克山师专学报,2002,21(3):4-5.
-
5潘亚平.叶绿体提取液中色素分离实验方法的改进[J].生物学杂志,1999,16(6):41-41. 被引量：1
-
6祁迎林,魏窦兴,达海兰,吴世亮.柴达木盆地唐古特白刺的抗逆性及其开发利用价值[J].草业科学,2004,21(9):13-15. 被引量：10
-
7Q 生物科学总论[J].中国生物学文摘,2003,17(9):1-1.
-
8徐晓舒,肖仲久.“酶的特性”实验方法的改进探索[J].遵义师范学院学报,2012,14(5):107-108. 被引量：2
-
9周方.分析微生物学及其现状[J].微生物学通报,1990,17(4):229-231.
-
10向珣朝,李平,王世全.水稻基因工程育种及其进展[J].西南科技大学学报,2004,19(2):107-113. 被引量：2
