摘要
为探究鸡TLR1A基因正选择nsSNP位点与沙门氏菌易感性的关联,挖掘其潜在的功能性位点,本研究利用多种生物信息学方法对ChTLR1A的21个nsSNP位点及基因的选择压力进行综合分析,筛选ChTLR1A正选择nsSNP功能性位点,深入分析其与鸡沙门氏菌易感性之间的相关性。结果显示,rs739087452(I388L)和rs313678806(C815R)在种上及种内均受到正选择作用,且rs739087452(I388L)位点的变异使其蛋白稳定性降低。rs313678806(C815R)与鸡沙门氏菌的易感性显著相关(P<0.001),C/C基因型为沙门氏菌抵抗型,表明rs313678806(C815R)可能是影响鸡沙门氏菌易感性的重要功能性SNP。本实验结果可为TLR1A基因标记在鸡抗病育种中的利用提供参考依据。
出处
《中国畜牧杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2023年第5期136-142,共7页
Chinese Journal of Animal Science
基金
河北省鸡现代种业科技创新团队优质特色燕山红玉肉鸡种质创制(21326303D-5)
河北省现代农业产业技术体系蛋肉鸡创新团队遗传资源开发与利用岗位专家项目
(HBCT 2018150201)
省属高校基本科研业务费优秀创新团队建设项目(2021JK15)。
