通过普通转录组测序挖掘调控松辽黑猪脂肪沉积的关键lnc RNA及其靶基因

脂肪沉积性状是养猪生产中重要的经济性状,本研究通过对3对具有极端背膘厚度的松辽黑猪全同胞(半同胞)个体的背部皮下脂肪组织进行普通转录组测序,鉴定得到1029个lncRNA,其中已知lncRNA 343个,新预测的lncRNA 686个。进行差异表达分析后,筛选到37个lncRNA和435个基因在高、低背膘组间差异表达。进一步对差异表达lncRNA进行靶基因预测,共得到54个顺式靶基因,245个反式靶基因,这些靶基因显著富集到多条脂肪合成及代谢相关的通路,包括脂肪酸代谢、不饱和脂肪酸的生物合成等。