巢式RT-PCR在肠道病毒分型鉴定中的应用研究

目的探讨巢式RT-PCR在肠道病毒分型鉴定中的应用。方法收集2015—2019年信阳地区各级医院收治的手足口病门诊及住院病人的粪便标本,其中肠道病毒阳性1863例。通过标本处理、核酸提取、逆转录、PCR反应、毛细管电泳、基因序列及分型鉴定。结果经过毛细管电泳确认,巢式RT-PCR可以成功对非EV-71和非CV-A16肠道病毒的部分VP1基因进行扩增,且目的产物片段长度大多介于350~400bp之间,这与文献描述相一致;将测序结果与Genbank数据库中的已知核苷酸序列进行比对,共检出了23种非EV-71和非CV-A16肠道病毒,共529份,占肠道病毒阳性病例的28.40%。结论巢式RT-PCR方法可成功对肠道病毒的部分VP1基因进行扩增,通过核苷酸序列比对确认肠道病毒的型别。