山羊CIDEa基因克隆及组织表达分析

为了探讨山羊诱导细胞凋亡DFF45样效应因子a(CIDEa)基因分子特征,了解其组织表达谱和在不同品种山羊之间的表达差异,试验对隆林山羊CIDEa基因进行克隆和生物信息学分析,采用实时荧光定量PCR方法检测CIDEa基因的组织表达情况。结果表明:克隆获得的隆林山羊CIDEa基因编码区(CDS区)全长为660 bp,编码219个氨基酸,蛋白质分子质量为23367.21 ku,属于亲水性不稳定膜外蛋白。与普通山羊CIDEa基因CDS区对比,隆林山羊CIDEa基因序列存在一个核苷酸突变位点,由亮氨酸变为脯氨酸。隆林山羊CIDEa基因与绵羊CIDEa基因同源性最高,与猪、猕猴、人的同源性较低,与大鼠、小鼠的遗传距离最远;隆林山羊CIDEa基因编码蛋白中α-螺旋占35.62%,T-转角占8.68%,β-氨基酸残基构成的延伸链占16.44%,无规则卷曲占39.27%;隆林山羊CIDEa基因在腹脂和皮下脂肪中高表达,其表达水平显著高于努比亚山羊,在其他组织中表达水平极低或不表达。说明试验成功克隆出隆林山羊CIDEa基因,该基因与山羊脂肪代谢有着密不可分的关系。