摘要
挖掘弥漫型胃癌相关差异表达基因,运用生物信息学方法探索发病机制。方法:从GEO数据库中寻找出弥漫型胃癌相关数据集,使用 R语言筛选差异表达基因。通过 DAVID网站进行GO功能富集分析和KEGG信号通路分析。在STRING网站中构建DEGs的PPI网络,并通过MCODE分析PPI网络子网络。利用cBioPortal在线网站验证Hub基因在弥漫型胃癌中表达情况和通过KM plotter绘制Hub基因生存曲线。结果:筛选出DEGs136个,这些基因在信号转导、细胞黏附、脂质消化、嘌呤代谢等方面具有重要作用,通过对PPI子网络分析获得10个Hub基因。通过生存曲线分析获得5个与胃癌预后相关的基因:CHEK1、ITGA7、ITGA8、MCM4、RRM2。结论:本研究获取了弥漫型胃癌的差异表达基因,并成功筛选与胃癌患者预后密切相关的Hub基因,为弥漫型胃癌的诊断和治疗靶点选择及预后判断提供参考。
