摘要
运用生物信息学方法探究HER2阳性乳腺癌脑转移组织中的差异表达基因(DEGs)。方法:从GEO数据库下载数据集并筛选出HER2阳性乳腺癌脑转移DEGs,对目的基因进行生物学功能(GO)分析,利用京都基因与基因组百科全书(KEGG)数据库对基因进行生物通路富集分析,同时使用String数据库和Cytoscape软件构建蛋白互作网络(PPI),使用MOCD插件筛选出核心基因,结合Kaplan-Meier plotter数据库对筛选出的DEGs进行预后分析。结果:共筛选出264个DEGs,其中152个上调,112个下调。DEGs参与细胞外基质、细胞外结构、细胞黏附和生物黏附等生物学过程,涉及ECM-受体相互作用、粘着斑、蛋白质消化吸收和蛋白多糖相关4条信号通路。经PPI网络分析筛选出17个核心靶基因,其中THBS2和NID2差异表达均显著影响HER2阳性乳腺癌患者的总体生存率。结论:THBS2和NID2可能参与HER2阳性乳腺癌脑转移的发生发展,与HER2阳性乳腺癌患者的预后相关,可以作为HER2阳性乳腺癌脑转移潜在的预测指标和治疗靶点。
