艾滋病患者外周血差异表达miRNA及其功能预测初步研究

研究HIV患者外周血中差异表达的miRNA及其调控的下游靶基因,为后续靶基因功能分析及HIV影响免疫功能的分子机制研究提供理论基础。方法:从基因芯片公共数据库GEO中下载HIV患者与正常人对照外周血的miRNA表达数据进行数据分析挖掘。结果:通过对HIV感染病人的外周血中372个显著差异表达的miRNA的靶基因GO聚类结果表明在免疫系统过程、细胞自噬以及细胞解毒等生物学过程显著聚体,提示HIV感染病人体内免疫系统相关基因受miRNA显著调控。KEEG信号通路富集提示差异miRNA靶基因,在Endocytosis(细胞内吞)信号通路富集程度最高,富集效率最显著。与HIV感染后病毒组装或机体感染后免疫因子分泌相关的35个miRNA中,下调23个,上调12个,并预测与疾病相关的靶基因。结论:艾滋病的发病与VPS37、MVB12B、SNX5、DAB2、IGFR2、EPN3等35个与HIV感染后病毒发展或机体感染后免疫因子分泌相关的基因变化相关。