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人肺鳞癌与癌旁组织的全长转录组研究

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摘要 分析导致肺鳞癌与癌旁组织在转录层面的异质性,挖掘肺鳞癌相关基因和通路,为肺鳞癌的致病机理提供进一步的证据。方法 通过对人肺鳞状细胞癌及其癌旁组织的全长转录组测序,并进行转录本注释、差异表达分析,挖掘肺鳞癌相关基因和通路。结果 在肺鳞癌与癌旁组织之间转录本的表达量存在差异,其中7471个转录本在肺鳞癌中高表达,5096个转录本在肺鳞癌中低表达。肺鳞癌与癌旁组织差异转录本KEGG通路富集结果显示,NF-kB信号通路中的基因在肺鳞癌发生发展过程中起关键调控作用。结论 通过转录组学,在肿瘤组织和癌旁组织找到了有差异的转录本信息,为肺癌的发病机制提供参考。
基金 国家重点研发计划“数字诊疗装备研发”重点专项(2018YFC0114500)基金资助项目。
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