摘要
基于生物信息学研究γ-氨基丁酸A受体δ亚基(gamma-aminobutyric acid type A receptor delta subunit,GABRD)在结肠癌中的表达情况,及其与免疫细胞浸润和预后的关系。方法 深入挖掘癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库,比较GABRD mRNA在结肠癌组织和正常组织中的表达差异,在Tumor Immune Estimation Resource (TIMER)网站分析结肠癌患者GABRD基因与免疫细胞浸润的关系及其与预后的关系,在UALCAN网站分析GABRD表达与预后和临床病理特征间的相关性,在Metascape网站对GABRD相关基因进行基因富集分析。结果 与正常组织相比,GABRD mRNA在结肠癌组织中高表达,且GABRD基因高表达的患者总生存率比低表达患者更低,预后更差。GABRD mRNA的表达与患者年龄和病理分期相关,而与性别和种族无关。在结肠癌组织中,GABRD的表达水平与CD4 T细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润水平呈正相关(P0.05),而与CD8 T细胞呈负相关(P0.05)。COX回归模型分析显示患者年龄和GABRD表达水平与患者预后呈正相关(P0.05),而CD8 T细胞与患者预后呈负相关(P0.05)。GABRD正相关关联基因主要参与了细胞黏附作用的调节、血管生成、细胞外基质的组织、细胞迁徙的正向调节、细胞活化作用和炎症反应等生物过程。结论 GABRD基因在结肠癌组织中高表达,且高表达与预后差密切相关,GABRD高表达与CD4 T细胞、巨噬细胞、树突状细胞浸润水平呈正相关。
