利用生物信息学方法分析HAMP基因在胃癌组织中表达及临床意义

探讨HAMP基因在胃癌(STAD)中的表达及临床价值,为胃癌的早期诊断和治疗提供新的思路。方法 利用TIMER、Ualcan数据库在线检索,下载TCGA数据库中的成对数据,R语言分析并可视化处理,分析HAMP基因在正常人体各器官组织、正常胃组织和胃腺癌组织中的mRNA表达情况。利用 Kaplan-Meier Plotter数据库分析胃癌患者生存期与HAMP表达的关系。通过String数据库在线检索HAMP的相关蛋白网络图,并进行功能注释和KEGG通路富集分析。TIMER数据分析免疫浸润物的的表达及对胃癌患者生存预后的影响。结果 HAMP基因在各级胃癌组织中的mRNA和蛋白均显著高于正常胃组织。此外,还发现HAMP的差异表达水平与病理分级、临床分期以及患者体重显著相关。生存分析发现,HAMP高表达的胃癌患者的OS、PFS、PPS显著缩短。String数据库分析发现,HAMP相关蛋白主要Apelin信号通路、系统性红斑狼疮信号通路、金葡菌感染信号通路及利什曼原虫信号通路,参与的生物学功能有调控细胞活化、单核细胞和淋巴细胞增殖。TIMER数据库分析显示HAMP mRNA 在胃癌免疫微环境中与B细胞、CD4+T细胞、CD8+T细胞、巨噬细胞、中性粒细胞、树突状细胞的表达呈显著相关性。结论 胃癌组织中HAMP基因显著高表达,其表达水平与胃癌的发生、发展及预后密切相关,可能是胃癌潜在的预后生物学标志物及治疗靶标。