基于GEO数据库的血管性痴呆疾病相关基因的生物信息学分析

基于生物信息学分析血管性痴呆发生发展过程中的关键基因及重要通路,为其发病机制的解析和治疗提供新的候选靶点和理论依据。方法 从基因表达数据库(GEO)下载GSE122063数据集,分为前额叶皮质(Frontal Cortex,VaD F)组和其对照(Control F)组,颞叶皮质(Temporal Cortex,VaD T)组和其对照(Control T)组。筛选组间差异表达基因(DEGs),通过对DEGs进行GO功能注释和KEGG通路分析、利用STRING获得蛋白相互作用数据、使用Cytoscape软件对互作数据进行分析,最终得到关键基因。结果 组间样本数据比较共有355个显著差异表达基因(|log2FC|≥1,P <0.05),其中上调基因107个、下调基因248个。共筛选出C1QA、CCL2、CCR5、CD33、CRH、GNG1等6个潜在的关键基因。通路分析显示差异表达基因主要富集于补体激活(病毒)、补体激活凝集素通路、钙信号通路等7条通路。结论 本研究为进一步研究血管性痴呆的发病机制提供了新的思路和理论依据。