基于网络药理学和分子对接方法探讨1,8-桉叶素药理作用的分子机制

通过网络药理学和分子对接预测1,8-桉叶素可能存在的作用靶点及分子机制。方法 通过PubChem数据库下载1,8-桉叶素2D结构式,利用PharmMapper和swissADME数据库预测靶点信息,将结果中输入Uniprot数据库提取和复核靶点基因名,再利用TTD数据库查询靶点对应的疾病信息,通过STRING数据库构建靶点关联网络,利用Metascape数据库进行GO生物进程以及KEGG信号通路富集分析。最后通过AutoDuck Vina对1,8-桉叶素与相关疾病和常见通路关键蛋白进行分子对接。结果 数据库筛选得到靶点基因103个,相关疾病信息187个,构建靶点与疾病关联网络得到度值较高的靶点基因有CTSB、ESR1、AChE、OPRM1、VDR等,得到度值较高的疾病有乳腺癌、心肌梗塞、2型糖尿病、慢性阻塞性肺疾病、急性骨髄性白血病等。GO分析具有显著意义的条目为脂质代谢、类固醇代谢过程、γ-分泌酶复合物、RNA聚合酶II转录调节复合物、溶酶体、神经元细胞体等生物进程。KEGG分析具有显著意义的条目为氮代谢、钙离子重吸收、自噬调节、胰岛素抵抗、癌症通路、溶酶体调节等信号通路。分子对接提示1,8-桉叶素的作用靶点与相关疾病和常见通路关键蛋白之间具有较好的结合性。结论 1,8-桉叶素具有多靶点,多通路及其作用广泛等特点,值得进一步深入研究和开发利用。