基于CiteSpace的国内肿瘤免疫治疗科学知识图谱可视化分析

对我国现有肿瘤免疫治疗的相关文献进行梳理和概括,探索该学科的发展趋势。方法 检索CNKI核心期刊数据库,查找文献共1555篇,统计每一年的文献篇数,使refworks格式导出,用CiteSpace软件针对作者、研究机构、关键词进行可视化分析。结果 文献数量呈上升趋势。2014年后增加呈井喷式。出现了410位核心作者,图谱中有3个较大聚类,聚类内节点和路径较多,聚类间的路径很少。军事医学科学院基础医学研究所、中国医学科学院、吉林大学第一医院肿瘤中心、第二军医大学免疫学研究所暨医学免疫学国家重点实验室为研究较为深入的机构;其中中国科学院为权威机构。免疫治疗、肿瘤、疫苗、树突状细胞、恶性肿瘤、肿瘤细胞这5个短语为核心关键词。结论 对肿瘤免疫治疗的研究至少历经26年,是近几年大热的主题。研究者较为集中,作者结构较为稳定,研究团队间合作较少,团队内合作频繁;大的研究机构间合作较少,未能使成果整合起来;过继细胞免疫治疗、PD-1/PD-L1抑制剂、CTLA-4抑制剂是目前肿瘤主要的免疫治疗方法。关键词:肿瘤;免疫治疗;文献计量;知识图谱;CiteSpace中图分类号:R737.33诺贝尔生理学奖于2018年授予发现肿瘤免疫检查点疗法的两位免疫学专家,他们为恶性肿瘤治疗开辟了一个新的领域。肿瘤免疫治疗的发展历程曲折而悠长,曾一度停滞不前,但分子生物学、肿瘤学等学科的飞速发展也推动了肿瘤免疫治疗工作的发展,现阶段主要应用在晚期肿瘤的二线治疗工作中也取得了很多突破性进展。科学知识图谱是以知识域(knowledge domain)为研究对象,该图像能够帮助我们看到知识结构关系和知识的发展进程,是一种知识可视化的表现。当前,在绘制科学知识图谱时,离不开这个CiteSpace工具的支持。1 材料与方法1.1 检索文献检索方法如下:在中国知网学术期刊数据库高级检索下检索。主题词为“肿瘤”、“免疫治疗”、“癌”,检索时间段为2018年10月10日前,检索期刊类别为核心期刊。共检索到1 555篇,全部纳入。检索到的文献时间段为1992年1月—2018年10月。1.2 数据转换检索到的文献以Refworks的格式导出,以download_**.txt的格式重命名。使用CiteSpace中自带的data→Import/Export格式转换功能转换为能被识别格式的文本文件,每条文本包括篇名、作者姓名、作者单位、所载期刊、关键词、摘要和发表时间。1.3 软件设置新建一个projec完成可视化分析,时间切片:从1992—2018年,每3年为1个分区。作者合作分析:Term Type:None;节点类型:Author;阈值选择:(Top N per slice)=50,进行聚类分析,用关键词标注聚类。机构合作分析:Term Type:None;节点类型:Institution;阈值选择:(Top N per slice)=50。前沿分析:Term Type:Noun Phrases;节点类型:keyword;阈值选择:(Top N per slice)=50。2 结果2.1 文献发表时间分析在某一时间段内发文量能表示研究者对这一领域的关注程度和这一领域的发展程度。1992—1996年这5年间,有153篇文献,平均每年30.6篇;1997—2001共发表160篇文献,平均每年发表32篇;2002—2006年共发表280篇,平均每年发表56篇;2007—2011年共发表300篇,平均每年发表60篇;2012—2017这6年间共发表564篇,平均每年发表94篇,2018年10月10日前发表了97篇文献。各年发表量见图1。图1 HPV疫苗相关文献发表量2.2 作者合作分析发表2篇及以上文献的作者共有856人,任秀宝发文量最高,为32篇。发表文章在20篇以上的作者有任秀宝、曹雪涛、蒋敬庭、谢小薰、陈虎。对作者进行聚类分析,并以关键词标记聚类,见图2,得到了3个较大的聚类,Modularity Q=0.972,Mean silhouette=0.673,聚类内链接密度和同质性较高,聚类划分可信。聚类内部有较多的节点路径,但三个聚类间的路径有限。注:显示标签的作者都发表过十篇以上的文献,标签字体的大小与发表文献量呈现正相关。节点、聚类以及路径的颜色由深蓝色到浅黄色为发表时间由由远及近。图2 作者合作聚类分析图根据普赖斯定律,N=0.749(ηmax)1/2,ηmax=32,N=4.23,取N=4,是发表文章在4篇以上即为核心作者。核心作者一共410人,占2篇以上作者数的47.9%,根据洛特卡定律推测,核心作者只占其中的19.2%。如果在短时间内,作者发表了大批相关的文献,词频会发生较大的变化,突现词会有较高的突现值。共有75名核心作者在短时间内有较高的突现值,表明在某些时间段,他们发表的该领域的文章量比较大。2.3 研究机构合作分析分析研究机构能够帮助我们找到该领域最具权威性的研究机构;通过判断机构间的合作,能够了解到该领域研究的成熟度和综合度。分析结果如下:共有1436家机构发表了2篇以上的文献。有15家机构发表了10篇以上的文献。军事医学科学院基础医学研究所、中国医学科学院、吉林大学第一医院肿瘤中心、第二军医大学免疫学研究所暨医学免疫学国家重点实验室这4家机构发文量在15篇以上,为研究这一领域较为深入的机构。如图3,机构的合作次数比较少,一些有合作关系的机构也很少共同发表文章;中国科学院与其他机构间的路径最多,即与其他机构合作最多。从时间来看,军事医学科学院基础医学研究所、中国医学科学院、吉林大学第一医院肿瘤中心、第二军医大学免疫学教研室、第二军医大学东方肝胆外科医院、华南肿瘤学国家重点实验室较早就对肿瘤的免疫疗法进行研究,近几年发展较快的有上海交通大学附属仁济医院妇产科、 第二军医大学免疫学研究所暨医学免疫学国家重点实验室、苏州大学附属第三医院肿瘤生物诊疗中心、天津市肿瘤防治重点研究室、中国医学科学院、吉林大学第一医院肿瘤中心。图3 研究机构分析图2.4 前沿分析一篇文献的关键词可以体现文献的主题,以突现词为知识基础的一组文献所探讨的现象是这一领域的热点问题。根据统计,2次以上出现的关键词有391个。在众多关键词中免疫治疗出现的频率高、中心性高,表明这个词备受人们关注,同时与一些节点联系较为紧密,可以算作是核心关键词。依关键词的出现次数、中心性、突现值,肿瘤细胞这5个短语核心。