肺动脉高压患者免疫相关标志物的筛选

利用生物信息学探索肺动脉高压(Pulmonary arterial hypertension ,PAH)的免疫细胞浸润特征以及与之相关的标志物,有助于PAH的早期诊断和免疫治疗。方法 合并GSE113439和GSE117261数据集后,我们使用CIBERSORT算法探索PAH患者和健康肺组织之间22种免疫细胞的组成。使用加权基因共表达网络分析(WGCNA)来探索关键模块和免疫细胞之间的相关性,对关键模块进行生物功能富集分析。通过支持向量机-递归特征消除法(support vector machine-recursive feature elimination ,SVM-RFE)、套索算法(least absolute shrinkage and selection operator ,LASSO)获得生物标志物。最后,通过 GSE48149数据验证生物标志物。结果 品红色模块与巨噬细胞M1正相关。综合筛选出SEPTIN6可作为PAH的潜在生物标志物。结论 SEPTIN6初步确定为PAH的潜在诊断标志物。