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基于系统生物学理论和分子对接技术探讨破格救心汤治疗急性肾衰竭的作用机制

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摘要 探讨、挖掘破格救心汤治疗急性肾衰竭(acute renal failure,ARF)的潜在机制与作用靶点。方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)、中医药证候关联数据库(SymMapv2)、中医药百科全书(ETCM)、中药高通量实验和参考数据库(HERB)检索方剂破格救心汤中附子、干姜、甘草、高丽参、山茱萸、生龙骨、生牡蛎、磁石、麝香的活性成分及作用靶点,再通过人类基因数据库(GeneCards)搜索ARF相关的靶点,并设置相关性≥20后导出;利用韦恩在线程序2.1.0版本将药物成分-疾病靶点去重并取交集,结果导入Cytoscape3.8.0软件中分析并构建成分-疾病靶点网络图;再利用 String在线网站及Cytoscape 3.8.0筛选出核心靶点,构建蛋白互作图 (protein-protein interaction,PPI);最后对筛选出的核心靶点蛋白互作网络进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,分子对接采用AutoDock Tools和AutoDock Vina进行,结果经Pymol处理。结果 前期数据挖掘与整合结果显示,破格救心汤中有潜在活性成分37个,作用靶点983个,疾病靶点502个,汤中活性成分与疾病共靶点143个,GO生物富集分析显示这些靶点涉及生物学过程BP共77个,细胞组分CC共26个,分子功能MF共19个,KEGG通路富集得出101条信号通路,分子对接显示破格救心汤中君药附子中次乌头碱、水黄皮素、谷甾醇与核心靶点STAT3、JUN、SRC具有良好对接结果。结论 破格救心汤中的各药物,尤其是君药附子主要是通过抑制STAT3蛋白的表达以阻碍 Hippo信号通路的激活,延缓肾小管损伤,从而达到治疗ARF的作用。
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