摘要
分析宏基因组二代测序在危重症患者感染中的诊断价值。方法 收集2020年11月—2022年10月中国人民解放军战略支援部队特色医学中心收治的66例危重症患者,所有患者均行传统病原学(CMT)检查和宏基因组二代测序(mNGS)检查,比较CMT和mNGS的诊断性能,并观察mNGS和CMT在病原体检测中的一致性,最后比较mNGS和CMT在病原微生物中的鉴定价值。结果 ①从细菌检测方面来看,mNGS的阳性率(88/114,77.19%)显著高于CMT(43/114,37.72%)(P<0.001)。从真菌检测方面来看,114例标本中仅19名(16.67%)患者的CMT结果报告阳性,而 mNGS 报告了32例(28.07%)阳性结果,两组比较差异有统计学意义(P<0.001);②在细菌检测方面,mNGS和CMT两种检测方法,30例标本(26.32%)完全匹配,60例标本(52.63%)部分匹配,24例标本(21.05%)不匹配。真菌检测方面,48例标本完全匹配,48例标本部分匹配,18例标本不匹配;③mNGS和CMT在114例标本中共鉴定出45种病原微生物(细菌、真菌)。肺炎克雷伯菌是最常检测到的病原体,其次是嗜麦芽寡养单胞菌。其中4例嗜肺军团菌,6例肺炎链球菌,4例粪肠球菌,10例纹带棒状杆菌仅被mNGS检测到。有关病毒检测,在114例样本中,最常见的为单纯疱疹病毒1型、其次为人巨细胞病毒。结论 宏基因组二代测序具有较好的诊断价值,可推广应用。
