ceRNA网络筛选桥本甲状腺炎免疫相关基因研究

基于生物信息学方法构建免疫相关的竞争性内源 RNA(ceRNA)网络。方法 从GEO数据库中下载桥本甲状腺炎的数据集,分析差异lncRNAs和mRNAs,通过miRcode数据库预测miRNA,利用TargetScan、miRDB及mirTarBase数据库预测差异mRNA并作功能富集分析,使用String数据库构建蛋白互作网络,cytoscape软件预测核心(hub)基因,与免疫相关基因取交集后,构建免疫相关ceRNA网络。结果 差异分析获得47个差异lncRNA,1800个差异mRNA,miRcode预测202miRNA,TargetScan、miRDB及mirTarBase预测1269个mRNA,其中98个为差异基因。String和cytoscape得到10个核心基因, 5个为免疫相关基因,构建了由15个lncRNA,5个miRNA 和5个mRNA组成的免疫相关ceRNA网络。结论 成功构建桥本甲状腺炎免疫相关的ceRNA网络,为后续研究桥本甲状腺炎的发生发展提供了重要的参考依据。