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基于生物信息学方法筛选脑动脉瘤中免疫浸润相关基因并构建miRNA-mRNA调控网络

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摘要 脑动脉瘤仍然是最具破坏性的神经系统疾病之一。然而,脑动脉瘤形成和发展的病理生理学机制仍不清楚。本研究的目的是确定脑动脉瘤中的关键microRNA(miRNA/miR)和核心基因,有助于阐明脑动脉瘤发生的机制。方法 在本研究中,通过利用基因表达总库整合mRNA的公开基因表达数据,并结合生物信息学预测,共鉴定出2211个差异表达的mRNA,通过免疫浸润分析、WGCNA分析以及PPI网络提取核心基因,最终筛选出了与免疫细胞浸润显著相关的前10个核心基因。这些靶基因的生物学功能和途径被证实为与脑动脉瘤相关。收集2021年09月至2022年9月牡丹江医学院附属红旗医院神经外二科进行开颅动脉瘤夹闭的患者样本以及4例对照组织进行miRNA测序分析,并进行差异分析,鉴定了52个差异表达的miRNA。通过miRWalk数据库预测了调控这些核心基因的miRNA,发现许多miRNA-靶基因对的表达水平呈负相关,它们被用来构建脑动脉瘤中miRNA-靶基因的调控网络。统计学分析均由R软件4.0.2版本进行完成,对于两组间计量资料的比较,若数据为正态分布,则使用t检验;若数据不服从正态分布,则使用秩和检验;相关性分析采用Spearman法进行。P<0.05表示有统计学意义。结果 本研究成功构建脑动脉瘤中miRNA-靶基因的调控网络,在这个网络中,发现了一些可能在脑动脉瘤中起关键作用的miRNA和基因,如hsa-miR-675-3p和hsa-miR-363-5p等17个miRNA,以及7个核心基因包括INSR、NOTCH3、CACNB1、NTRK2、TRDN、KCND3和TAC1。结论 本研究中的综合分析通过构造miRNA-靶基因的调控网络可能有助于理解脑动脉瘤的潜在分子机制和寻找新的治疗靶点。
出处 《中文科技期刊数据库(引文版)医药卫生》 2024年第1期0108-0113,共6页
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