生信分析筛选多囊卵巢颗粒细胞相关关键基因及候选药物预测

探讨颗粒细胞相关基因在多囊卵巢综合征发生发展中的作用,筛选关键基因进行靶基因药物预测。从GEO数据库下载GSE193123、GSE34526基因芯片,通过 GEO2R筛选差异表达基因,R软件对差异表达基因进行GO 及KEGG分析,利用Cytoscape进行PPI网络的模块及关键基因筛选。之后在GSE102293基因芯片验证关键基因的表达,采用Coremine Medical、DGIdb数据库筛选与关键基因相关的药物。最终筛选出82个差异表达基因,在此基础上,筛选出MMP-9、ICAM-1、IL-10、CD44共4个关键基因,在GSE102293基因芯片中验证后,针对4个关键基因预测了29个西药和8个中药。总之,MMP-9、ICAM-1可能通过流体剪切应力和动脉粥样硬化信号通路对PCOS的发生发展产生影响,有望成为PCOS新的治疗靶点。