表达谱芯片和DNA甲基化芯片联合分析肥胖相关分子靶标

通过甲基化芯片和表达谱芯片联合分析,发现肥胖相关的异常甲基化修饰的差异表达基因。方法 通过公共数据库下载多个肥胖相关的芯片数据进行综合分析得到甲基化修饰的差异表达基因,并进行富集分析和蛋白互作网络构建。筛选关键基因,最后对关键基因进一步验证其甲基化及基因表达情况。结果 总共筛选出213个甲基化修饰的差异表达基因,其中89个在肥胖患者中上调,124个下调。并筛选出8个关键基因分别是:COL15A1、ITGB5、COL4A2、COL27A1、COL6A2、COL6A3、COL18A1、LAMB1。对关键基因进一步验证发现,只有ITGB5仍在肥胖患者中表现出低甲基化状态和高表达的mRNA水平。结论 ITGB5可能是治疗肥胖的潜在靶点。