摘要
本研究旨在用生物信息学方法挖掘此前未被充分关注聚焦、且在口腔鳞状细胞癌(OSCC)发生发展中发挥关键促癌作用的核心促癌基因。方法 从ICGC数据库、GEO数据库(GSE246050和GSE217142数据集)获取OSCC生存风险基因、OSCC表达上调基因、和OSCC复发上调基因。选取共性交集基因,排除交集基因中不一致的基因,最终获得关键OSCC促癌基因。结果 通过生物信息学分析得出共有9个核心促癌基因。在物理相互作用网络中,SPP1、TNC、COL11A1和MMP13等处于hub位置。在miRNA-mRNA匹配网络中,TRAM1、RAI14、COLL11A1和CTHRC1位于重要节点,且miR-524同时靶向多个核心促癌基因,可能具有潜在的治疗价值。结论 本研究基于生物信息学数据集联合分析,提出了9个关键OSCC促癌基因:CAMK2N1、MMP13、FZD6、SPP1、RAI14、TRAM1、TNC、COL11A1和CTHRC1,并发现他们独特的富集通路、互作网络及共同靶向miRNA。
