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生信方法分析BAX在乳腺癌中的表达及其预后价值

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摘要 探讨BAX基因在乳腺癌中的表达情况及其与患者预后的关系。方法 应用TIMER、GEPIA2、HPA等数据库分析BAX在乳腺癌及癌旁组织中的表达差异,提取BAX在乳腺癌中的表达数据和患者预后信息,并分析其表达水平与乳腺癌患者病理学参数之间的相关性;利用TIMER数据库分析BAX在泛癌组织及癌旁组织中的差异表达;利用HPA数据库分析了BAX在正常乳腺组织和乳腺癌组织中的不同表达;利用GEPIA2数据库探讨BAX转录本在乳腺癌中的表达及其结构特征;京都基因组百科全书(KEGG)数据库用于识别生物过程群和通路群;并利用KM数据库对乳腺癌患者进行了预后分析。结果 在TIMER数据库中,与正常乳腺组织相比,BAX在乳腺癌组织中的表达明显增加(P<0.001)。利用HPA数据库确定了BAX在乳腺癌组织中的阳性表达,与癌旁组织具有显著差异。GEPIA2数据库显示BAX-202转录本在乳腺癌中表达突出,且BAX-001、BAX-003、BAX-004、BAX-005、BAX-006和BAX-201中都含有Bcl-2结构域。Km生存曲线分析显示,BAX的上调对总生存率(OS)有显著影响(P=0.017),且雌激素受体(ER)、人表皮生长因子受体-2(HER-2)状态和淋巴结转移阳性与BAX的表达呈正相关。KEGG通路分析显示DNA损伤导致P53的激活,进而导致BAX的上调,但两种基因之间缺少互作,有可能发生变异等等。结论 BAX在乳腺癌中上调,BAX上调的患者OS明显降低。BAX可作为乳腺癌的诊断标志物和治疗靶点。通过建立BAX的共表达网络并进行生物信息学分析,可以找到评估患者预后的生物标志物。这一发现为乳腺癌的机制和细胞研究提供了一个新的靶点。
作者 孟祥宇
出处 《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》 2024年第10期0048-0052,共5页
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