SARS相关病毒与鼠肝炎病毒S蛋白的同源暗示一个潜在受体结合区的存在

最近,一种新的冠状病毒被确定为近期爆发的严重急性呼吸综合征(SARS)的病原体。虽然人们对人冠状病毒229E已经有了较多的研究,而且其受体结合位点也被确定在S蛋白第417～547个氨基酸残基之间。但是,这一区域与新分离的SARS相关病毒(香港株,CUHK-W1)没有任何同源性。有意思的是,已知的各种冠状病毒S蛋白S1亚基的序列比对和进化分析显示,鼠肝炎病毒(MHV)与SARS相关病毒的同源性最高。而且,MHV的S蛋白上负责受体结合的重要位点(第62～65和第214～216位氨基酸残基)与SARS相关病毒的相应区域(第51～54和第195～197位氨基酸残基)高度同源。这些生物信息学的分析结果可能对研究SARS相关病毒的受体结合位点和病毒侵染靶细胞的机理有所帮助,进而为设计抗病毒药物和疫苗提供新靶点。