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濒危植物单羽苏铁SSR引物的筛选 被引量:1

Screening SSR primers for endangered plant Cycas simplicipinna(T.Smitinand)K.Hill
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摘要 以濒危植物单羽苏铁为材料,利用改良的CTAB法提取其总DNA.利用5个单羽苏铁居群的91个个体,对已从苏铁属其他植物开发的65对核SSR引物进行筛选,并对引物的多样性指数进行检测分析.共筛选到多态性高、扩增稳定的SSR引物20对.在这20对引物中,检测到的等位基因数平均为9.75,有效等位基因数平均为4.769,香农多样性指数平均为1.473,观察杂合度平均为0.380,期望杂合度平均为0.636,固定指数只有引物4的小于0.绝大多数引物都偏离了哈迪-温伯格定律,并达到了极显著水平.以上结果为单羽苏铁的遗传多样性和遗传结构的进一步分析提供了依据. 以濒危植物单羽苏铁为材料,利用改良的CTAB法提取其总DNA.利用5个单羽苏铁居群的91个个体,对已从苏铁属其他植物开发的65对核SSR引物进行筛选,并对引物的多样性指数进行检测分析.共筛选到多态性高、扩增稳定的SSR引物20对.在这20对引物中,检测到的等位基因数平均为9.75,有效等位基因数平均为4.769,香农多样性指数平均为1.473,观察杂合度平均为0.380,期望杂合度平均为0.636,固定指数只有引物4的小于0.绝大多数引物都偏离了哈迪-温伯格定律,并达到了极显著水平.以上结果为单羽苏铁的遗传多样性和遗传结构的进一步分析提供了依据.
出处 《云南大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 北大核心 2012年第S2期419-425,共7页 Journal of Yunnan University(Natural Sciences Edition)
基金 国家自然科学基金委-云南联合基金(U1136602)
关键词 濒危植物 单羽苏铁 SSR引物筛选 遗传多样性 endangered plant Cycas simplicipinna screening SSR primers genetic diversity
  • 相关文献

参考文献24

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共引文献33

同被引文献13

引证文献1

二级引证文献3

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