给予生物信息平台分析miR-21靶基因参与食管癌病理过程可能的信号通路

目的:选择经试验验证的miR-21靶基因并分析其相关生物信息学过程,为深入研究miR-21在食管癌发生、发展过程中的分子机制提供了理论依据。方法:通过TarBase检索经实验证实的miR-21靶基因及靶基因验证的具体实验方法、靶向位点、调控方式、文献出处等注释信息,采用证实的基因簇,采用GO(GeneOntology)基因注释及KEGG基因信号通路富集的方法进行生物信息学分析。结果:(1)经检索目前经实验证实的miR-21靶基因数量为525个,其靶基因与多种疾病相关尤其是肿瘤。(2)miR-21的靶基因主要涉及调控核糖体、细胞骨架、基因转录、过渡金属离子结合、DNA结合、核苷酸结合、锌离子结合等生物过程,参与癌症信号通路、MAPK、信报因子受体互动、细胞周期、p53、分子粘附等信号通路。结论:miR-21的靶基因可能通过调控多个信号通路参与食管癌的发病机制,且这些信号同理可能以癌症相关信号通路为主。