表达序列标签法寻找日本血吸虫新基因

目的 运用表达序列标签(expressed sequence tag，EST)技术，从日本血吸虫成虫eDNA文库中筛选和鉴定日本血吸虫新基因，为寻找日本血吸虫新的候选疫苗奠定基础。方法 转化日本血吸虫成虫eDNA文库，随机挑取重组阳性克隆进行测序，获得Esr；用NCBI站点的GenBank对所获得的新基因序列进行同源性检索；利用BLASTP程序对同源性高的基因进行核苷酸和氨基酸水平的同源性比较。结果 发现xzw000008克隆的eDNA序列为日本血吸虫新基因并获得GenBank登录号。该eDNA序列与曼氏血吸虫polyubiquitin基因高度同源，核苷酸水平的同一性为87％；氨基酸水平的同一性为98％。结论 用EST寻找日本血吸虫新基因是一种可行的方法，所筛选到的日本血吸虫新基因长575bp，编码191个氨基酸，与曼氏血吸虫polyubiquifin基因高度同源，为进一步研究该基因的全序列及功能作准备。