RSCA技术应用于HLA-A,B座位高分辨基因分型的研究

High resolution HLA-A, B typing by RSCA

目的采用参比链介导的构象分析(referencestrandmediatedconformationanalysis,RSCA)技术,建立新型、可靠的HLAA、B高分辩基因分型方法,应用于HLA基因分型及供、受者组织配型。方法采用一对座位特异性引物,扩增HLAA、B基因的第2、3外显子和第2内含子。扩增产物与单链标记荧光物质的参比链按一定比例混合,经变性、退火反应及脱水处理后,在杂交产物中掺入分子量内参标准物,用ABI377型基因测序仪电泳检测。用ABIGeneScan3.1软件分析每一泳道内异源双链波峰的迁移值、峰高及峰面积值,RSCAHLATyper1.3软件分析HLA等位基因型。应用本方法,对第13届国际组织相容性协作组(IHW)送检的20份盲检样本,以及2份HLA等位基因型已知的质控样本进行了检测。结果2份质控DNA的检测结果,与已知的HLA基因型完全相符;20份盲检样本HLAA、B座位的检测结果,与IHW公布的结果完全相同,准确率达100%。结论RSCA为新型、高分辨水平的HLA基因分型方法,并且出现模棱两可结果的情况少,分型结果准确、可靠。