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一种基于极值域组合的多序列联配求精算法

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摘要 多序列联配(MSA)是一个NP问题,常用的方法有渐进法和迭代法,但渐进方法不能调整早期的错误,迭代方法面临怎样跳出局部最优的问题。针对多序列联配问题,提出了极值域组合思想和挖掘策略,极值域组合能够减少搜索空间,易于找到全局最优解。最后得到一种基于极值遗传算法和挖掘策略的多序列联配求精算法。算法用来自于数据库BAliBASE中的数据进行了验证。
作者 胡桂武
出处 《湖南税务高等专科学校学报》 2005年第5期50-52,共3页 Journal of Hunan Taxation College
  • 相关文献

参考文献2

  • 1(巴西)J.塞图宝(JoaoSetubal),(巴西)J.梅丹尼斯(JoaoMeidanis),朱浩等.计算分子生物学导论[M]科学出版社,2003.
  • 2Da-Fei Feng,Russell F. Doolittle. Progressive sequence alignment as a prerequisitetto correct phylogenetic trees[J] 1987,Journal of Molecular Evolution(4):351~360

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