摘要
大部分真核生物mRNA的加工涉及到mRNA前体的分裂/多聚腺苷化,在3’-末端形成多聚腺苷酸(poly(A))尾巴.为了研究水稻mRNA前体多聚腺苷化过程所必需的poly(A)加尾信号、下游调控元件和poly(A)位点等序列的特点,用3’-末端带有poly(A)的EST与全长cDNA序列进行比较,建立了一个来自9953个基因的、覆盖12969条poly(A)位点两侧各40碱基序列的数据库.结果发现,只有7.9%的mRNA使用AAUAAA作为加尾信号,超过60%使用AAUAAA的1~2个碱基变化的序列作为加尾信号,11.5%的mRNA使用AAUGAA及其单碱基变化的加尾信号.在约25%的mRNA的3’.末端存在多个poly(A)位点.在90%的mRNA前体的加尾信号下游都能检测到富含U/GU的调控元件,尤其在以AAuAAA的多碱基变化序列作为加尾信号的mRNA前体中,半数以上都能在poly(A)位点两侧检测到下游调控元件.而且,这些调控元件的位置对poly(A)位点的选择有限制作用.总之,虽然水稻mRNA加尾信号的保守性较低,但大量下游调控元件的存在保证了多聚腺苷化过程的正常进行.
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2006年第7期819-826,共8页
Chinese Science Bulletin
基金
国家高技术研究发展计划(批准号:2002AA221003)
中国科学院和上海市科学技术委员会(批准号:038019315)资助项目.