摘要
通过对Ｍａｄａｌｉｎｅ深入研究，同时结合蛋白质一级结构由局部编码方案获得的输入输出编码的特性，对Ｍａｄａｌｉｎｅ网络作了改进：删除了训练和预测过程中的部分乘法和加法运算以缩短训练学习和预测时间；以非线性作用函数代替原来的线性作用函数以提高其预测精度。通过对３１个蛋白质共５７２０个氨基酸残基的训练学习，预测了９个蛋白质共１０９１个氨基酸残基，结果表明：与经典Ｍａｄａｌｉｎｅ网络相比，改进Ｍａｄａｌｉｎｅ的训练学习速度提高了１４倍；其平均精度也由原来的６０．６１％提高到６３．０５％。
Basedonthethoroughstudyofthisalgorithm,andconsideringthecharacterofthecodeininputandoutputlayeraccordinglocalcodingscheme,animprovedMadalineal-gorithmwasdesigned,whicheliminatedsomemultiplayingandadditiveoperationsbutitsre-sultswereconstantforthepurposeofshorteningthetimeoftrainingandpredicting,andusedthenon-linearactivationfunctioninsteadoflinearfunctioninordertoenhanceitsabili-tyofadaptationinintricateinformationandthepredictingaccuracy.Theresults,whichthetrainingandpredictingsetinvolving31and9proteinsincluding5720and1091aminoacidresiduesrespectively,showedthattheimprovedMadalinealgorithmcouldenhancethepre-dictingaccuracyfrom60.61%to63.05%anditstimewaslessone-fourteenththanthetra-ditionalMadaline′s.
出处
《中国药科大学学报》
CAS
CSCD
北大核心
1996年第6期366-369,共4页
Journal of China Pharmaceutical University
基金
江苏省自然科学基金
关键词
Madaline网络
蛋白质
二级结构
ImprovedMadaline
Predictionofthesecondarystructureofprotein
NeuralNetwork
