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修饰Cu,Zn超氧化物歧化酶的分子动力学模拟

MOLECULAR DYNAMIC SIMULATION OF MODIFIED COPPER, ZINC SUPEROXIDE DISMUTASE
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摘要 使用分子力学和分子动力学方法建造并优化月桂酸修饰Cu,Zn超氧化物歧化酶的结构,优化结果与晶体结构数据之间骨架均方根偏差0.170nm.并在溶剂存在的条件下,对修饰酶进行了分子动力学模拟和构象分析,讨论了其结构与性能的关系,认为月桂酸修饰链无序性带来的熵效应是提高修饰酶稳定性的主要原因. The structure of lauric acid modified copper, zinc superoxide dismutase was built and minimized using molecular mechanics and molecular dynamics. The root mean square differences of backbone between minimized modified molecule and x-ray result is 0. 170nm.The dynamics simulation of modified enzyme was carried out in the presence of solvent.The relationship between structure and activity was analyzed. It was considered the entropy effect which was brought by the side chain of lauric acid patched to the enzme had the main role of increasing the stability of modified enzyme.
出处 《南开大学学报(自然科学版)》 CAS CSCD 1996年第1期91-94,共4页 Acta Scientiarum Naturalium Universitatis Nankaiensis
基金 天津市高等教育局重点学科资助
关键词 超氧化物歧化酶 修饰酶 分子动力学 结构 superoxide dismutase moified enzyme molecular dynamics
  • 相关文献

参考文献2

  • 1阎家麒,生物化学与生物物理进展,1994年,21卷,154页
  • 2杨保珍,中国医药工业杂志,1990年,21卷,519页

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