丙型肝炎病毒NS5A基因的克隆及序列比对分析

目的:研究HCV N S5A区基因的结构与功能,为提高干扰素(IFN)治疗HCV感染的有效性提供依据,及为建立以N S5A蛋白做抗原的新一代诊断试剂盒,提高HCV感染检出率作出有益的尝试。方法:以含HCV 1b全长cDNA的质粒HCV 17为模板,利用巢式PCR扩增出一段长约500bp的cDNA片段,以此基因片段作为目的基因,进行T-A克隆,构建PMD 18-T-N S5A。结果:经酶切及测序证实,PMD 18-T-N S5A质粒中的插入基因片段为HCV 1b N S5A区部分基因,与HCV标准株HCV J序列进行比对分析,核苷酸和氨基酸序列的同源性均为90%以上,并且该区段包含了干扰素敏感决定区(ISDR)。结论:建立HCVN S5A基因片段稳定的无性繁殖系,并进行同源性分析对研究ISDR序列与IFN疗效的关系是非常重要的;通过基因重组表达N S5A蛋白,可用于HCV诊断试剂盒的研究。