期刊文献+

面向生物信息的结构关系模式挖掘约束条件分析

下载PDF
导出
摘要 结构关系模式挖掘是数据挖掘领域一个全新的分支,它包括并发关系模式挖掘、互斥关系模式挖掘、重复关系模式挖掘及有序关系模式挖掘。随着大量基因序列数据的获取人们正在研究各种方法从海量的基因数据中挖掘有用的信息。本文基于结构关系模式挖掘理论,对DNA序列从时间、空间、距离等不同角度分析了DNA序列中存在结构关系模式的可能性,并对生物信息的结构关系模式挖掘的约束条件进行分析。
作者 张雪 陈未如
出处 《科技资讯》 2006年第36期245-246,共2页 Science & Technology Information
  • 相关文献

参考文献2

二级参考文献14

  • 1沈yu fei 方福德.真核基因表达调控[M].北京:高等教育出版社,1996.236-254.
  • 2Blattner FR, Plunkett G 3rd, Bloch CA, et al. The complete genome sequence of Escherichia coli K-12 [J]. Science, 1997,277(5331): 1453-1474.
  • 3Fraser CM, Norris SJ, Weinstock GM, et al. Complete genome sequence of Treponemapallidum, the syphilis spirochete [J].Science, 1998,281 (5375) :375-388.
  • 4Fraser CM, Casjens S, Huang WM, et al. Genomic sequence of a Lyme disease spirochaete ,Borrelia burgdor feri[J]. Nature,1997,390(6660) : 580-586.
  • 5Kunst F, Ogasawara N, Moszer I, et al. The complete genome sequence of the grampositive bacterium Bacillus subtilis [J].Nature, 1997,390(6657) :249-256.
  • 6Himmelreich R, Hilbert H, Plagens H, Herrmann R. Complete sequence analysis of the genome of the bacterium Mycoplasma pneumoniae[J ]. Nucleic Acids Res, 1996,24 (22): 4420-4449.
  • 7Nakamura Y,Gojobori T,Ikemura T. Codon usage tabulated from the international DNA sequence databases, its status 1999 [J]. Nucleic Acids Res,1999,27(1) :292.
  • 8Lobry JR. Asymmetric substitution patterns in the two DNA strands of bacteria[J]. Mol Biol Evol, 1996,13(5):660-665.
  • 9McLean JM, Wolfe KH, Devine KM. Base composition skews, replication orientation and gene orientation in 12 prokaryote genomes[J]. J Mol Evol, 1998,47 (6) : 691-696.
  • 10Kroyh A,Mian IS,Hanssler D. A hidden Markov model that finds genes in E. coli DNA[J]. Nucleic Acids Res, 1994,22(22) :4768-4778.

共引文献8

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部