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一种简单、有效的适于PCR操作的放线菌DNA提取方法 被引量:57

A Quick and Efficient Method for Genomic DNA Extraction from Actionbacteria
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摘要 目的:利用改良酶法发展了一种从微量(几百微升)发酵液中快速安全的提取放线菌基因组DNA的方法。方法:利用溶菌酶破壁,蛋白酶K和SDS除蛋白,成功提取较高质量的放线菌基因组DNA,所得的DNA可作为PCR反应的模板进行16SrRNA等基因有效扩增。结果:能从海绵和土壤分离的放线菌中成功提取基因组DNA。结论:该方法操作简单、费用低廉、不使用酚、氯仿等有毒害作用有机试剂,非常适于长期从事放线菌操作的研究人员。为大量放线菌菌株的快速鉴别、高通量筛选和系统分类研究创造了条件。 Objective:A brief and safe method of extracting genomic DNA from small-scale(hundred microlitres) actinobacterial fermentation was developed.Method: Lysozyme was used to lysis cell wall and proteinase K and SDS was used to remove protein.Conclusion: Genomic DNA was extracted successfully from actinobacteria isolated from marine sponge and soil;The DNA is suitable for PCR amplification.The method can be used in actinobacteria systematics and rapid identification.
出处 《生物技术》 CAS CSCD 2007年第1期39-41,共3页 Biotechnology
基金 中科院南海海洋研究所所长基金项目("海洋难培养微生物资源的药物开发" 1187000009) 广东省自然科学基金博士启动金项目("南海海绵共附生微生物的抗菌活性成分研究" 06301287) 中科院"百人计划"专项基金项目资助
关键词 放线菌 基因组DNA提取 PCR 16S DNA Actinobacteria Genomic DNA extraction PCR 16S rDNA
  • 相关文献

参考文献7

  • 1Hopwood D H,Bibb M J,Chater K F,et al.Genetic Manipulation of Actomyces A Laboratory manual.In Preparation of chromosomal,plasmid and phage DNA[M].Norwich:F1 Crowe & Sons Ltd.1985:79-801.
  • 2Orsini M,Romano-Spica V.A microwave-based method for nucletic acid isolation from environmental samples[J].Lett Appl Microbiol,2001,33:17-20.
  • 3郑维,权春善,朴永哲,范圣第.一种快速提取细菌总DNA的方法研究[J].中国生物工程杂志,2006,26(4):75-80. 被引量:35
  • 4徐平,李文均,徐丽华,姜成林.微波法快速提取放线菌基因组DNA[J].微生物学通报,2003,30(4):82-84. 被引量:171
  • 5Li X,De Boer S H.Selection of polymerase chain reaction primers from an RNA intergenic spacer region for specific detection of Clavibacter michiganensis subsp.sepedonicus[J].Phytopathol,1995,85 (8):837-842.
  • 6马万里,Josquin Tibbits,Mark Adams.一种可用于PCR扩增的直接提取土壤细菌DNA的方法[J].土壤通报,2004,35(1):56-58. 被引量:9
  • 7Atlas R M,Park L C.Handbook of Microbiological Media[M].CRC Press,Inc.,corporate Blvd.,N.W.,Boca Raton,Florida 2000,33431.

二级参考文献34

  • 1J萨姆布鲁克.分子克隆实验指南[M].北京:科学出版社,1992..
  • 2F奥斯伯 颜子颖译.精编分子生物学实验指南[M].北京:科学出版社,1998.671.
  • 3北京大学生物系生物化学教研室.生物化学实验指导[M].北京:人民教育出版社,1983.87,24.
  • 4颜子颖 王海林译.精编分子生物学指南[M].北京:科学出版社,1998.366-373.
  • 5日本放线菌学会编.放线菌の分类と同定[M].,2001.83,88.
  • 6Orsini M, Romano-Spiea V. Lett Appl Microbiol, 2001, 33:17~20.
  • 7Hopwood D H, Bibb M J, Chater K F, et al. Genetic Manipulation of Streptomyces A Laboratory manual. In Preparation of chromosomal, plasmid and phage DNA. Norwich: F. Crowe & Sons Ltd. 1985, 79~80.
  • 8Yeates C,et al.PCR amplification of crude microbial DNA extracted from soil[J].Letters in Applied Microbiology,1997,25:303-307.
  • 9Andrew Ogram.Discussion Soil molecular microbial ecology at age 20:methodological challenges for the future[J].Soil Biology & Biochemistry,2000,32:1499-1504.
  • 10Christon J Hurst,et al.Manual of environmental microbiology[J].A S M Presss,Washington,D.C.1997.

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同被引文献775

引证文献57

二级引证文献479

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