特异性抗肝癌单链抗体HscFv4-16的分子模建

目的:模建特异性抗肝癌单链抗体HscFv4-16的三维结构,为高亲和力的抗肝癌单链抗体的人源化设计提供结构信息。方法:采用同源模建技术,在SGI图形工作站上,通过Accelrys公司InsightⅡ软件包的Homology模建分子结构,用Discover进行分子力学和动力学优化,最后用Prostat验证模拟结构的合理性。结果:HscFv4-16结构6个CDR襻位于Fv段的N端,形成一个与抗原结合的口袋,口袋深15.6。用Prostat验证,模建的三维结构的81.3%的Φ和Ψ分布于Ramachandran图的核心区域,模板1NQB的为83.2%。结论:成功模建特异性抗肝癌单链抗体HscFv4-16的三维结构,模拟结构合理可靠。