期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息

氨基酸在蛋白质空间结构中的深度倾向性因子 被引量：4

Depth Tendency Factor of Amino Acid in Protein
下载PDF
导出
摘要 用统计和几何方法给出了氨基酸在蛋白质空间结构中的深度计算,并利用PDB数据库得到了不同氨基酸在蛋白质中的深度倾向性因子,并得到了这些倾向性因子与氨基酸的物理、化学综合特性的相关性质. We construct a statistical and geometrical method for the calculation of amino acid depth in protein structures. Via this method, we get the depth tendency factor for each of the 20 amino acid types, and discover the relationship between depth tendency factors and the chemical and physical properties of amino acid.
作者 沈世镒 胡刚 张华
机构地区 南开大学数学科学学院与LPMC
出处 《生物数学学报》 CSCD 北大核心 2007年第2期305-310,共6页 Journal of Biomathematics
基金 天津大学 南开大学联合研究项目 刘徽应用数学研究中心与国家自然科学基金(批准号:10271061 90208022)资助资助
关键词 蛋白质空间结构 统计理论中的深度分析 氨基酸在蛋白质中的深度倾向性因子 Protein spatial structure Depth analysis in statistics Depth tendency factor of amino acid in protein
分类号 O29 [理学—应用数学]
  • 相关文献

参考文献15

  • 1Christensen H,Pain R H.The Contribution of the Molten Globule.In Oain R.H.ed Mechanisms of Protein Folding[M].Oxford:Oxford University Press,1994,55-78.
  • 2Hamaguhi K.The Protein Molecule,Conformation,Stability and Folding[M]Tokyo:Japan Scientifie Soci-eties Press,1992,71-84.
  • 3Lee B,Richards F M.The interpretation of protein structures:estimation of static accessibility[J].J Mol Biol,1971,55(3):379-400.
  • 4Chakravarty S,Varadarajan R.Residue depth:a novel parameter for the analysis of protein structure and stability[J].Struct Fold Des,1999,7(7):723-732.
  • 5Pintar A,Carugo O,Pongor S.Atom Depth as a Descriptor of the Protein Interior[J].Biophysical,2003,84(4):2553-2561.
  • 6Thorton J,Taylor W R.Structure Prediction[A].In:Findlay J.B.C.,Geisow M.J.eds.Protein Aequenc-ing[C].Oxford IRL Press,1989,147-190.
  • 7Berman H M,Westbrook J,Feng Z,et al.The Protein Data Bank[J].Nucleic Acids Research,2000,28(1):235-242.
  • 8Hobohm U,Sander C.Enlarged representative set of protein structures[J].Protein Sci,1994,3(3):522-524.
  • 9Liu R Y,Parelius J M.Singh K Multivariate analysis by data depth:Descriptive statistics,graphics and inference(with discussion)[J] Ann Statist,1999,27(3):783-858.
  • 10Liu R Y,Parelius J M,Singh K Multivariate analysis by data depth:Descriptive statistics,graphics and inference(with discussion)[J] Ann Statist,1999.27(3):783-858

同被引文献54

引证文献4

二级引证文献5

生物数学学报
2007年 第2期

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部