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仔猪12种致病菌的16 S rRNA分析 被引量：1

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摘要 研究仔猪12种致病菌的16 S rRNA基因序列,分析其亲缘关系,为设计其16 S rRNA基因的诊断探针提供理论依据。从美国国家生物技术信息中心(NCBI)基因库中下载332条仔猪12种致病菌的16S rRNA基因序列,应用双序列比对和构建系统进化树的方法对这些序列进行种内分析,选出每种细菌的代表序列,再对代表序列用同法进行种间分析,并将种间分类结果与伯杰氏细菌分类手册(第8版)的分类结果进行比较。从每种细菌的数据库中选出一条接近16 S rRNA基因序列全长,与同种其他序列的核苷酸替代率差异较小的序列为该种细菌的代表序列,进行种间16 S rRNA基因序列系统进化分析,结果与伯杰氏细菌分类手册(第8版)的分类基本一致。该16 S rRNA基因的系统进化分析所提供的信息将用于下一步针对这12种致病菌的16 S rRNA基因诊断探针的设计。
作者 梁之昶 陈小玲 相磊 章振华 姚刚 杨兵
机构地区 新疆农业大学动物医学院 北京市农林科学院畜牧兽医研究所 江西农业大学动物医学院
出处 《动物医学进展》 CSCD 2007年第7期102-106,共5页 Progress In Veterinary Medicine
关键词 16 S RRNA基因 致病菌 双序列比对 系统进化分析 仔猪
分类号 Q789 [生物学—分子生物学] S858.28 [农业科学—临床兽医学]
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引证文献1

动物医学进展
2007年 第7期

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