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基因本体及其注释数据语义网模型 被引量：1

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摘要 目前基因本体在语义网研究领域还很滞后,无法提供复杂的语义查询和推理服务.本研究通过将异构的原始数据以统一的RDF(resource description framework)格式进行编写,建立跨基因子本体的语义映射,并在此基础上引入一系列的推理规则集,提出了一个RDF语义网模型——GORouter.进一步,通过选择OracleNDM(network datamodel)作为RDF容器,使得RDF语义推理结果能够与传统的关系型查询无缝结合在一起,最终为用户提供了一个基于GORouter的混合解决方案(http://www.scbit.org/gorouter/).
作者 黄钰 许庆炜 刘谦 张国庆 李亦学 鲁强
机构地区 华中科技大学生物医学光子学教育部重点实验室 上海生物信息技术研究中心
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第22期2618-2624,共7页 Chinese Science Bulletin
基金 国家高技术研究发展计划(批准号:2006AA02Z343 2006AA02A312) 国家重点基础研究发展计划(批准号:2003CB715901) 上海科委重大项目(批准号:06DZ22920)资助
关键词 基因本体 语义网 本体映射 ORACLE NDM
分类号 Q75 [生物学—分子生物学]
  • 相关文献

参考文献1

二级参考文献12

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引证文献1

二级引证文献20

科学通报
2007年 第22期

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