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跨膜蛋白结构预测新方法 被引量：5

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摘要 基因组数据中大约有20%～30%的基因产物被预测为膜蛋白,膜蛋白是一类具有重要生物功能的蛋白质.预测膜蛋白跨膜区的数量和位置是生物信息学中重要的研究课题.提出了一种预测膜蛋白跨膜区的新方法——连续小波变换极大值谱(MSCWT).该法对8种SARS-CoV膜蛋白的预测准确度与常用膜蛋白预测软件TMpred相当,对MPtopo数据库中131种新的已知结构的螺旋束蛋白(共包含548个跨膜区)的预测显示,其跨膜螺旋区预测准确率为91.6%,膜蛋白序列的预测准确率为89.3%.
作者 刘宏德 王睿 卢小泉 陈晶 刘秀辉 丁兰
机构地区 西北师范大学化学化工学院 西北师范大学生命科学学院
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2007年第23期2742-2745,共4页 Chinese Science Bulletin
基金 国家自然科学基金(批准号:20775060 20335030) 第4届教育部高校青年教师奖 甘肃省高分子重点实验室资助项目
关键词 连续小波变换极大值谱(MSCWT) 膜蛋白 跨膜区
分类号 Q51 [生物学—生物化学]
  • 相关文献

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共引文献33

同被引文献125

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引证文献5

二级引证文献17

科学通报
2007年 第23期

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