摘要
基因表达调控决定了基因组中遗传信息表达为影响细胞生命活动的蛋白质组的数量、成分和功能,现有的电子细胞模型对基因表达调控模拟得较少。提出Analog-Cell电子细胞模型,通过定义反应过程中的调节因子和酶以及制定合理的反应规则,有效地模拟了基因表达中主要的调控机制,真实地再现了细胞内基因表达这一生命活动,并得到了比较理想的模拟结果。
The regulation of gene expression determines the quantity, structure and functions of proteome that are translated by the genetic information of genome and affect the life activities of cells. Existing electronic cell (E-Cell) models seldom relate to simulation on the regulations of gene expressions. In this paper, the E-Cell model named Analog-Cell was proposed. It simulated the main regulation mechanisms of gene expression through defining regulation factors, enzymes and rational reaction rules. Thus Analog-Cell realistically represents the procedure of gene expression and obtains recommendable simulation results.
出处
《计算机应用》
CSCD
北大核心
2008年第4期927-930,938,共5页
journal of Computer Applications
基金
国家自然科学基金资助项目(60496321
60473003)
教育部高等学校博士学科点专项科研基金项目(20050183065)
吉林省科技发展计划重大基金资助项目(20040526)
吉林省杰出青年基金资助项目(20030107)
关键词
电子细胞
人工生命
基因表达调控
生物信息学
Electronic Cell (E-Cell)
artificial life
regulation of gene expression
bioinformatics