期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息

梗死后大鼠缺血心肌基因差异表达谱构建 被引量：1

原文传递
导出
摘要 为寻找梗死后大鼠缺血心肌差异表达基因,采用结扎Wistar大鼠冠状动脉左前降支的方法,建立急性心肌梗死(AMI)模型,饲养7d后处死大鼠,提取正常和缺血心肌总RNA,应用长标签基因表达系列分析(long serial analysis of gene expression,LongSAGE)构建AMI后大鼠缺血心肌基因差异表达谱,荧光定量PCR鉴定部分差异基因的表达.结果显示,在建立的AMI后缺血心肌和正常心肌组织LongSAGE标签库中,共获得标签15966个,正常心肌获得9646个,梗死后缺血心肌获得9563个.通过NCBI网站BLAST同源性分析后,发现新核苷酸序列标签7665个.与正常组比较,142个基因在AMI大鼠心肌组织中的表达有显著性差异(P<0.05),这些差异基因主要与氧化磷酸化、三磷酸腺苷(ATP)合成、糖异生等能量代谢通路相关.荧光定量PCR的鉴定结果与LongSAGE差异表达结果基本一致.结果表明,AMI可引起多基因表达异常,能量代谢作用通路相关基因的异常表达是造成AMI后心肌损伤的重要分子机制.
作者 郭春雨 殷惠军 蒋跃绒 薛梅 史大卓
机构地区 中国中医科学院西苑医院心血管病中心
出处 《科学通报》 EI CAS CSCD 北大核心 2008年第14期1657-1663,共7页 Chinese Science Bulletin
基金 国家自然科学基金资助项目(批准号:30572430)
关键词 急性心肌梗死 WISTAR大鼠 长标签基因表达系列分析 基因差异表达谱 能量代谢
分类号 R542.22 [医药卫生—心血管疾病]
  • 相关文献

参考文献16

  • 1Velculescu V E, Zhang L, Vogelstein B, et al. Serial analysis of gene expression. Science. 1995, 270(5235): 484--487.
  • 2Horvath A, Mathyakina L, Vong Q, et al. Serial analysis of gene expression in adrenocortical hyperplasia caused by a germline PRKAR1A mutation. J Clin Endocrinol Metab, 2006, 91(2): 584--596.
  • 3Saha S, Sparks A B, Rago C, et al. Using the transcriptome to annotate the genome. Nat Biotechnol, 2002, 20(5): 508--512.
  • 4张润峰,王继生.建立大鼠心肌梗死模型的若干问题探讨[J].山西医科大学学报,2004,35(1):13-15. 被引量：29
  • 5Pfaffl M W. A new mathematical model for relative quantification in real-time RT-PCR. Nucleic Acids Res, 2001, 29(9): e43.
  • 6Enerson B E, Drewes L R. The rat blood-brain barrier transcriptome. I Cereb Blood Flow Metab, 2006, 26(7): 959--973.
  • 7Rafiee P, Shi Y, Pritchard K A Jr, etal. Cellular redistribution of inducible Hsp70 protein in the human and rabbit heart in response to the stress of chronic hypoxia: Role of protein kinases. J Biol Chem, 2003, 278(44): 43636--43644.
  • 8Webster K A. Programmed death as a therapeutic target to reduce myocardial infarction. Trends Pharmacol Sci, 2007, 28(9): 492--499.
  • 9陆松敏,李伟文,王正国.缺血缺氧与线粒体DNA损伤[J].创伤外科杂志,2001,3(4):295-297. 被引量：10
  • 10范作文,王均志,黄从新.线粒体与心肌细胞凋亡的研究进展[J].中华心血管病杂志,2002,30(5):317-318. 被引量：15

二级参考文献30

  • 1周村建,郝飞,王鲁,钟白玉.白念珠菌总RNA提取的实验研究[J].中华皮肤科杂志,2004,37(8):494-495. 被引量：11
  • 2钱伟,谢毅,张宝仁,朱家麟,郝家骅,陈如坤,蔡凯华,吴小舟.风湿性心脏病心肌线粒体DNA^（4977）的定量研究[J].中华医学杂志,1995,75(8):473-475. 被引量：5
  • 3缪明永,朱善宏,石汉平,陈克明.失血性休克时大鼠肝线粒体内膜的损伤[J].中国病理生理杂志,1995,11(1):86-89. 被引量：15
  • 4富路,杨继红,刘薇,张淑华,曲秀芬,吴楠.扩张型心肌病与线粒体DNA缺失片段的研究[J].哈尔滨医科大学学报,1996,30(5):436-438. 被引量：3
  • 5李露斯,汪青松,闫国和,蔡昌启.大鼠脑缺血后脑线粒体功能的改变[J].中华神经科杂志,1996,29(6):329-331. 被引量：7
  • 6Lo H J, Kohler J R, DiDomenico B, et al. Nonfilamentous C. albicans mutants are avirulent[J]. Cell, 1997, 90(5): 939-949.
  • 7Chen J J, Rowley J D, Wang S M. Generation of longer cDNA fragments from serial analysis of gene expression tags for gene identification[J]. Proc Natl Acad Sci U S A, 2000, 97(1): 349-353.
  • 8Chen J, Lee S, Zhou G, et al. High-throughput GLGI procedure for converting a large number of serial analysis of gene expression tag sequences into 3′ complementary DNAs[J]. Genes Chromosomes Cancer, 2002, 33(3): 252-261.
  • 9Staab J F, Ferrer C A, Sundstrom P. Developmental expression of a tandemly repeated, proline-and glutamine-rich amino acid motif on hyphal surfaces on Candida albicans[J]. J Biol Chem, 1996, 271(11): 6298-6305.
  • 10Swoboda R K, Bertram G, Budge S, et al. Structure and regulation of the HSP90 gene from the pathogenic fungus Candida albicans[J]. Infect Immun, 1995, 63(11): 4506-4514.

共引文献50

同被引文献15

  • 1殷惠军,张颖,蒋跃绒,罗兰,刘颖,史大卓,陈可冀.西洋参叶总皂苷对急性心肌梗死大鼠心肌细胞凋亡及凋亡相关基因表达的影响[J].中国中西医结合杂志,2005,25(3):232-235. 被引量：37
  • 2张铭,周胜华.心肌缺血的能量代谢障碍治疗进展[J].心脏杂志,2006,18(4):467-468. 被引量：15
  • 3邵南齐,朱萱萱.西洋参皂苷对心肌缺氧缺血的药理学研究进展[J].实用中医内科杂志,2007,21(3):3-4. 被引量：7
  • 4Lee S D, Kuo W W, Lin J A, et al. Effects of long-term intermittent hypoxia on mitochondrial and Fas death receptor dependent apoptotic pathways in rat hearts. Int J Cardiol, 2007, 116:348-356.
  • 5Cui X S, Li X Y, Jeong Y J, et al. Gene expression of Cox5a, 5b,or 6b1 and their roles in preimplantation mouse embryos. Biol Reprod, 2006, 74:601-610.
  • 6Weinberg J M, Venkatachalam M A, Roeser N F, et al. Mitochondrial dysfunction during hypoxia/reoxygenation and its correction by anaerobic metabolism of citric acid cycle intermediates. Proc Natl Acad Sci USA, 2000, 97:2826-2831.
  • 7Wolff A A, Rotmensch H H, Stanley W C, et al. Metabolic approaches to the treatment of ischemic heart disease: The clinicians' perspective. Heart Fail Rev, 2002, 7:187-203.
  • 8Livak K J, Schmittgen T D. Analysis of relative gene expression data using real-time quantitative PCR and the 2(-Delta Delta C(T)). Methods, 2001, 25:402-408.
  • 9Arocho A, Chen B, Ladanyi M. Validation of the 2-DeltaDelta Ct calculation as an alternate method of data analysis for quantitative PCR of BCR-ABL P210 transcripts. Diagn Mol Pathol, 2006, 15: 56-61.
  • 10ZhangJ, Liem D A, Mueller M, et al. Altered proteome biology of cardiac mitochondria under stress conditions. J Proteome Res, 2008, 7:2204-2214.

引证文献1

二级引证文献2

科学通报
2008年 第14期

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部