人卵透明带3蛋白的二级结构和B细胞抗原表位预测

Prediction of the secondary structure and B cell epitopes for the ZP3 protein of Homo Sapiens

目的：预测并综合分析人卵透明带3（human zona pellucida 3,hZP3）蛋白的二级结构及其B细胞抗原表位。方法：以hZP3蛋白的基因序列为材料,采用Garnier-Robson法、Chou-Fasman法和Karplus-Schulz法预测其结构蛋白的二级结构及蛋白骨架区的柔韧性,采用Kyte-Doolittle法对蛋白的亲水性进行分析,Emini法预测蛋白的表面可能性,Jameson-Wolf法预测蛋白的抗原指数。结果：hZP3蛋白含有较多的β折叠和转角结构。该蛋白第27～31、36～46、114～133、140～151、237～240和324～329区段可能是α-螺旋中心;hZP3蛋白分子第52～54、60～67、74～78、100～111、158～169、181～185、190～193、210～218、226～229、311～317、335～349和353～360区段可能是β-折叠中心。hZP3蛋白具有多处抗原指数较高的区段,其中近中部区段和近羧基端的第92～95、132～137、171～178、239～245、252～255、279～286、292～305和319～324区段含有潜在的B细胞优势抗原表位。结论：以蛋白质的二级结构预测作为辅助手段,用抗原指数、亲水性参数和表面可能性参数预测hZP3蛋白的B细胞抗原表位,为实验确定hZP3蛋白的B细胞抗原表位并以此进行免疫避孕研究奠定基础。

Objective： To predict and analyze the secondary structure and B cell epitopes of zona pellucida glycoprotein 3 in Homo Sapiens （hZP3）. Methods： The secondary structure and flexible regions of hZP3 protein were predicted by the methods of Garnier- Robson, Chou Fasman and Karplus-Schulz based on hZP3 gene sequence. Moreover, hydrophilieity plot, surface probability plot and antigenic index of hZP3 protein were predicted by the methods of Kyte-Doolittle, Emini and Jameson-Wolf, respectively. Results： hZP3 protein contained more t; sheet and turn regions. There are several centers of α helix in the No. 27～ 31, 36～46, 114～133, 1404151, 237～240 and 324～329 of hZP3 protein. There are more centers of sheet in the No. 52～54, 60～67, 74～78, 100～111, 158～169, 181～185, 190～193, 210～218, 226～ 229, 311～317, 335～349 and 353～360 ofhZP3 protein. Moreover, theB cellepitopes possibly localized in or nearbyhZP3 protein＇s central and C terminal region of No. 92～95, 132～137, 171～-178, 239～245, 252～255, 2794286, 292～305 and319～324. Conclusion： These results are helpful for identification of B cell epitopes for hZP3 protein and the research of immunocontraception based on these epitopes using experimental methods.