基于优势比的多因子降维法在SNP交互分析中的应用

在遗传关联研究中,识别SNP交互对研究复杂疾病的易感性有重要作用。多因子降维法(multifactor dimen-sionality reduction,MDR)可以用来识别多位点基因型与疾病的关系,但容易出现假阳性错误。为此,本文提出基于优势比的多因子降维法(odds ratio-multifactor dimensionality reduction,OR-MDR),将优势比作为量化指标研究SNP交互对疾病带来的风险。结果表明,OR-MDR方法要优于传统的MDR方法,它可以按照优势比对风险SNP交互进行排序,发现与疾病关联最强的SNP交互,这是传统的MDR方法所不能比拟的。