2003～2008年广西猪繁殖与呼吸综合征病毒分离株分子流行病学调查

GP5是猪繁殖与呼吸综合征病毒（PRRSV）变异最大的结构蛋白，能够诱导机体产生中和抗体。2003～2008年从广西各县市采集PRRSV阳性病料，扩增得到的49株PRRSVORF5基因序列，并对序列进行比较和分析。49个毒株的ORF5分别属于美洲型的Ⅰ、Ⅱ、Ⅳ亚群．推导氨基酸分析发现：在中和表位区域GXLZ-1、GXLZ-2由H^38→N^38、L^39→I^39，Ⅱ亚群所有毒株序列由L^39→I^39；在R^13和R^151毒力相关位点，GXGG-1变为Q^13，GXLZ-1和GXLZ-2变为K^151，其他毒株未发生突变，推测Ⅱ亚群广西毒株的毒力比Ⅰ、Ⅳ亚群的强；从2003—2005年和2006—2008年这2个时间段分析，在9aa、16aa、54aa、59aa、94aa、104aa、185aa出现了时间性的基因变异；遗传进化树分析发现，随着时间的推移，获得的广西毒株与CH-1a、MLV株亲缘关系逐渐发生偏离，2006年6月之后所获得毒株亲缘关系很近，相互之间同源性很高，且与国内PRRSV变异毒株JXA1高度同源，推断2006年后获得的毒株与变异株可能由同一毒株演化而来。