一种利用RT-PCR特异扩增甲型流感病毒HA基因多变区片段并测序确定分型的方法
被引量:3
Subtyping of type A influenza by sequencing the variable regions of HA gene specifically amplified with RT-PCR
摘要
针对甲型流感病毒HA基因的H1,H2,H3,H5,H7和H9亚型的序列特征,设计专用PCR引物,通过RT-PCR特异扩增相应片段并测定序列,可以准确地区分H1和H3感染人类的流感病毒及其亚型.这种基于流感病毒核酸序列测定的特异性检测方法,不仅可以用于新型甲型H1N1病毒的快速确诊和分型,并且还可推广应用于今后其他流感病毒或具有爆发潜力的新型流感病毒的监测.
出处
《科学通报》
EI
CAS
CSCD
北大核心
2009年第12期1648-1651,共4页
Chinese Science Bulletin
参考文献3
-
1Ghedin E, Sengamalay N A, Shumway M, et al. Large-scale sequencing of human influenzareveals the dynamic nature of viral genome evolution. Nature, 2005, 437:1162--1166.
-
2Leutenegger C M, Higgins J, Matthews T B, et al. Real-time TaqMan PCR as a specific and more sensitive alternative to the branched- chain DNA assay for quantitation of simian immunodeficiency virus RNA. AIDS Res Hum Retroviruses, 2001, 17:243--251.
-
3Li K B. ClustalW-MPI: ClustalW analysis using distributed and parallel computing. Bioinformatics, 2003, 19:1585--1586.
同被引文献18
-
1中国疾病预防控制中心.甲型HINl流感监测方案ES3.2009-05-11[EB/0L].http://www.chinacdc.net.cn/n272442/n272530/n273736/n273781/n4624704/n4661330/index.html.
-
2Dawood F S,Jain S,Finelli L,Shaw M W,Lindstrom S,Garten R J,Gubareva L V,Xu X,Bridges C B,Uyeki T M.2009.Emergence of a novel swine-origin influenza A (H1N1) virus in humans[J].The New England Journal of Medicine,360(25):2605-2615.
-
3Lamb R A,Krug R M.1996.Orthomyxoviridae:the Viruses and Their Replication[M].Philadelphia:Lippincott-Raven Publishers:1353-1395.
-
4Lau S K,Chan K H,Yip C C,Ng T K,Tsang O T,Woo P C,Yuen K Y.2009.Confirmation of the first HongKong case of human infection by novel swine origin influenza A (H 1N 1) virus diagnosed using ultrarapid,real-time reverse transcriptase PCR[J].Journal of Clinical Gastroenterology,47(7):2344-2346.
-
5Liu Y,Childs R A,Matrosovich T,Wharton S,Palma A S,Chai W,Daniels R,Gregory V,Uhlendorff J,Kiso M,Klenk H D,Hay A,Feizi T,Matrosovich M.2010.Altered receptor specificity and cell tropism of D222G hemagglutinin mutants isolated from fatal cases of pandemic A (H1N1) 2009influenza virus[J].Journal of Virology,84 (22):12069-12074.
-
6Matrosovich M,Zhou N,Kawaoka Y,Webster R.1999.The surface glycoproteins of H5 influenza viruses isolated from humans,chickens,and wild aquatic birds have distinguishable properties[J].Journal of Virology,73(2):1146-1155.
-
7Qi X,Pang B,Lu C P.2009.Genetic characterization of H1N1 swine influenza A virus isolated in eastern China[J].Virus Genes,39(2):193-199.
-
8Yan J H,Xiong Y,Yi C H,Sun X X,He Q S,Fu W,Xu X K,Jiang J X,Ma L,Liu Q.2012.Pandemic (H1N1) 2009 virus circulating in pigs,Gunagxi,China[J].Emerging Infectious Disease,18(2):357-359.
-
9晓彤.农业部成功研制出猪感染甲型H_1N_1病毒检测试剂盒[J].中国牧业通讯,2009(10):17-17. 被引量:1
-
10李广波,潘欣.2009甲型H1N1流感病毒新进展[J].医学研究生学报,2010,23(1):90-93. 被引量:11
引证文献3
-
1刘佳,柳敏,顾兵,潘世扬.甲型H1N1流感病毒实验室检测方法研究进展[J].临床检验杂志,2011,29(3):214-215. 被引量:6
-
2史芳芳,李红叶.不同方法检测流感病毒的敏感性[J].国际检验医学杂志,2011,32(18):2112-2112. 被引量:2
-
3颜健华,梁丹洁,李春英,徐贤坤,胡巧云,孙翔翔,何奇松,熊毅.H1N1猪流感病毒广西分离株HA基因序列分析[J].南方农业学报,2013,44(7):1196-1200. 被引量:3
二级引证文献11
-
1张巍巍,张丽荣,胡钰.3种流感病毒检测方法的比较和应用[J].中国实验诊断学,2012,16(9):1642-1645. 被引量:3
-
2陆小梅,黎四平,何月敬,彭琪,刘绍基.呼吸道感染患儿1256例多种呼吸道病毒抗原检测结果分析[J].实用儿科临床杂志,2012,27(22):1733-1735. 被引量:68
-
3秦金勇.流感病毒的实验室检测方法及进展探究[J].中国卫生产业,2012,9(34):136-136.
-
4胡英会,张景亮,杨继红.呼吸道感染IgM联检试剂盒临床应用评价[J].公共卫生与预防医学,2013,24(2):105-105. 被引量:7
-
5杨帆,廖国阳.乙型流感病毒检测方法的研究进展[J].国际检验医学杂志,2013,34(10):1258-1260. 被引量:7
-
6薛晓丽,李阳,唐旭清.基于H1N1型禽流感病毒的HA蛋白序列进化树研究[J].计算机应用研究,2015,32(9):2634-2638. 被引量:1
-
7王溪,王敏,单志刚,张晓敏,陈锦艳,郑优荣,付涌水,张伟东,戎霞.广州地区无偿献血人群中HIN1和H3N2流感病毒中和抗体的分布及水平[J].国际输血及血液学杂志,2016,39(3):216-220.
-
8阮宝阳,王林,宫晓倩,刘晓敏,张鹏,汪琪,李泽君,童光志,于海.欧洲禽源H1N1亚型猪流感病毒抗体间接ELISA检测方法的建立[J].中国动物传染病学报,2016,24(2):13-19. 被引量:2
-
9李建林,薛晓丽,唐旭清.H1N1流感病毒的HA、NA蛋白序列进化树[J].食品与生物技术学报,2016,35(10):1035-1040.
-
10郭鸿,叶荣,李斌,刘健.新型冠状病毒肺炎与甲型H1N1流感流行病学与临床特点的对比分析[J].兰州大学学报(医学版),2020,46(2):62-69. 被引量:3
-
1甲型H1N1流感防控知识[J].资料信息,2009(6).
-
2肖满田.儿童如何预防甲型H1N1流感[J].教育导刊(下半月),2009(6):52-52.
-
3追踪甲型H1N1流感病毒的进化途径[J].生物技术世界,2009(4):43-43. 被引量:1
-
4英破解新流感基因[J].经济导报,2009(19):26-26.
-
5张仲秋:我国将采取有力措施防控新型流感病毒[J].兽医导刊,2009(5):5-8.
-
6人兽共患传染病全解读[J].新华月报,2009(13):68-70.
-
7张艳,赵大鹏,戚凤春,汪春义,张雪梅,范洪学,王坤.甲型流感病毒HA基因核酸疫苗表达载体的构建及表达[J].中国生物制品学杂志,2008,21(2):133-135. 被引量:2
-
8邵洪泽,邵显波,石春军.猪流感的流行特点、临床表现及诊断方法[J].兽医导刊,2009(5):35-37. 被引量:1
-
9宋宇,黄勇.魏氏梭菌α毒素基因的克隆表达及其间接ELISA方法的建立[J].四川畜牧兽医,2012,39(6):31-35.
-
10肖越胜,宿春虎,黄瑶,张军,彭大新.扬州市近3年新甲型H1N1流感病毒HA基因分析[J].扬州大学学报(农业与生命科学版),2013,34(1):36-40. 被引量:6