期刊文献+

山东省分离强毒株猪伪狂犬病病毒SA株TK基因结构与进化分析 被引量:5

下载PDF
导出
摘要 对山东省分离强毒株猪伪狂犬病病毒SA株TK基因进行了克隆和部分序列测定,并分析比较了该序列与国内外主要流行毒株伪狂犬病病毒Ea株、Min-A株、LA株、Kroea株、Kaplan株、SH株的同源性。结果表明:核苷酸序列的同源性分别为99.0%、99.1%、98.9%、99.0%、98.3%和74.4%;氨基酸序列的同源性分别为98.7%、98.4%、98.4%、98.7%、98.3%和74.8%;猪伪狂犬病毒SA株TK基因具有疱疹病毒胸苷激酶催化结构域的保守氨基酸共有的对应于这两个亚结构域的特征基序,其蛋白的二级结构由α-螺旋(45.38%)、β-折叠(14.46%)、β-转角(6.02%)和无规则卷曲(34.14%)组成;将猪伪狂犬病毒TK基因与鸡、牛、猫科、马科、人类的胸苷激酶用DNASTAR绘制进化树进行分析,可知猪疱疹病毒Ⅰ型TK基因亲缘关系与哺乳动物的疱疹病毒较近,而与禽类的相对较远。
出处 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2009年第8期76-79,共4页 Heilongjiang Animal Science And veterinary Medicine
基金 滨州市应用技术研究与开发项目(200706) 山东省滨州畜牧兽医研究院青年科技创新基金项目(2007-02)
  • 相关文献

参考文献6

  • 1ROMERO C H P, MEADE J, SANTAGATA K, et al. Genital infection and transmission of pseudorabies virus in feral swine in Florida USA[ J]. Vet Microbiol, 1997,55 : 131 - 139.
  • 2FERNANDAZ A, MENENDEZ DELCAMPO A M, FERNANDEZ S, et al. Conversion of US3 - encoded protein kinase gene from pseudorabies virus in a diploid gene located within inverted repeats by genetic recombination between the viral genome isomers [ J ]. Virus Res, 1999,61 (2) :125 - 135.
  • 3萨姆布鲁克J 拉塞尔DW著 黄培堂 译.分子克隆实验指南[M].北京:科学出版社,2002.481-482.
  • 4GEOURJON C, DELEAGE G. SOPMA: Significant improvement in protein secondary structure 'prediction by consensus prediction from multiple alignments[ J ]. Cabios, 1995,11:681 - 684.
  • 5MULLER C W, SCHULZ G E. Structure of the complex between adenylate kinase from Escherichia coli and the inhibitor Ap5A refined at 1.9 A resolution. A model for a catalytic transition state [ J ]. J Mol Biol, 1992,224 ( 1 ) :159 - 167.
  • 6KLEMENS W, THOMAS B, ANDRE A,et al . The three- dimensional structure of thymidine kinase from Herpes simplex virus type 1 [J]. FEBS Letters,1995,368(2) : 289 -292.

共引文献171

同被引文献40

引证文献5

二级引证文献22

相关作者

内容加载中请稍等...

相关机构

内容加载中请稍等...

相关主题

内容加载中请稍等...

浏览历史

内容加载中请稍等...
;
使用帮助 返回顶部